93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0780 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0780  single-strand binding protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1664  single-strand binding protein  70.19 
 
 		 154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286469  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  39.33 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  40.26 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  31.11 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  34.07 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  34.33 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  33.75 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  32.22 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  32.05 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  34.31 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  32.97 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  38.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  34.57 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  34.57 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.48 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.48 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  34.04 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  31.11 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  33.71 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  29.59 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  29.69 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  35.44 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  32.91 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl081  single-stranded DNA-binding protein  37.25 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.34874e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  32.88 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  32.88 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  35.38 
 
 		 168 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  29.89 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 154 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  33.85 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  33.85 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  33.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  33.85 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  32.31 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  29.03 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  32 
 
 		 111 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  33.85 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  33.85 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  30.14 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  33.85 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  32.94 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  34.21 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  29.2 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>