176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1664 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1664  single-strand binding protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286469  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0780  single-strand binding protein  64.88 
 
 		 161 aa  200  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  38.64 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  37.36 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  40.48 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  36.25 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  43.84 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  43.84 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  37.66 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  42.47 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6345  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  40.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.0648509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  36 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  39.39 
 
 		 111 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  36 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  34.26 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  39.39 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  31.75 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  35.38 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  37.33 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  36 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  31.07 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.54 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  36 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  33.73 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  32.93 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  35.38 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  41.11 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  26.58 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  27.78 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  37.1 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  43.1 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  32.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  32.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  32.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  35.94 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  35.94 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  32.73 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4278  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  40 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  32.99 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>