More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0639 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0639  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1474  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  54.84 
 
 
187 aa  227  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.844119  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0206  putative O-acetyltransferase  55.98 
 
 
186 aa  204  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0936  hexapaptide repeat-containing transferase  44.57 
 
 
188 aa  190  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1950  galactoside O-acetyltransferase  42.86 
 
 
188 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3378  galactoside O-acetyltransferase  44.51 
 
 
188 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3268e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2028  O-acetyltransferase, putative  42.86 
 
 
188 aa  174  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4924  hexapaptide repeat-containing transferase  45.95 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2050  galactoside O-acetyltransferase  42.08 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.120347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3234  galactoside O-acetyltransferase  41.4 
 
 
188 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3319  O-acetyltransferase  40.86 
 
 
188 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.201285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3282  galactoside O-acetyltransferase  40.86 
 
 
188 aa  167  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0014286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3580  O-acetyltransferase  40.86 
 
 
188 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3534  putative O-acetyltransferase  40.86 
 
 
188 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000489104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1322  acetyltransferase  44.75 
 
 
191 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.399456  normal  0.0536984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2414  CysE/LacA/LpxA/NodL family O-acyltransferase  44.62 
 
 
193 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4506  hexapaptide repeat-containing transferase  39.57 
 
 
192 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.039815  normal  0.175474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4214  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.89 
 
 
192 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0578  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.17 
 
 
200 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.566139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01930  hypothetical protein  40.76 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.611243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0793  acetyltransferase  35.26 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2632  acetyltransferase  35.68 
 
 
188 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01941  VioB, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  33.82 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18690  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.58 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  28.74 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  29.59 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5775  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.7 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  28.67 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  27.33 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  30.06 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  27.54 
 
 
251 aa  58.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  28.31 
 
 
209 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  30.23 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  28.57 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.22 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  28.06 
 
 
304 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3152  acetyltransferase  27.38 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0592  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  27.54 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  29.25 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  29.94 
 
 
312 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  26.67 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.01 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  25.95 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.39 
 
 
316 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  29.33 
 
 
310 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1700  hexapaptide repeat-containing transferase  28.93 
 
 
246 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  26.58 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1399  hexapaptide repeat-containing transferase  27.38 
 
 
209 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3000  hexapaptide repeat-containing transferase  25.41 
 
 
231 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  29.5 
 
 
309 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  26.58 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  25.16 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2517  hexapaptide repeat-containing transferase  26.75 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.467085  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  28.38 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  25.48 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.11 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.46 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.18 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2207  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.91 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  32.81 
 
 
313 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4229  hexapaptide repeat-containing transferase  25.3 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  28.12 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  29.91 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  28.21 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  43.64 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  28.03 
 
 
173 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4118  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  26.63 
 
 
205 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  25.52 
 
 
198 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.39 
 
 
181 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  29.2 
 
 
317 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  26.28 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  26.17 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.77 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.93 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  26.67 
 
 
185 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  26.09 
 
 
171 aa  51.2  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0513  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  42.37 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  25.32 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  27.11 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  41.82 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1182  acetyltransferase, putative  34.44 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.142998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  27.94 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  29.01 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  26.75 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  29.09 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  24.12 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  24.68 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  24.12 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  28.78 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.75 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  26.17 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  28.67 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  26.11 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.19 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  27.78 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  25.64 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  27.78 
 
 
571 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.68 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  42.37 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.851243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>