More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2830 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  38.99 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  42.65 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  44.63 
 
 
188 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  45.59 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  43.8 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.51 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000791  acetyltransferase  40.99 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  45.6 
 
 
191 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  44.63 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  36.31 
 
 
191 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  44.63 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  43.8 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  37.42 
 
 
184 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  40.74 
 
 
160 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06688  acetyltransferase  45.67 
 
 
184 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  38.03 
 
 
187 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  36.77 
 
 
187 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  37.42 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0123  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  43.28 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  38.78 
 
 
192 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  37.97 
 
 
187 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  39.22 
 
 
186 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  36.84 
 
 
204 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  39.71 
 
 
191 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  39.72 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  39.72 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.54 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  39.72 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  40.29 
 
 
187 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2566  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.42 
 
 
187 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  39.57 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  39.84 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  37.18 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  35.9 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  40.97 
 
 
185 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4711  galactoside O-acetyltransferase  39.47 
 
 
199 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.410287  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  39.52 
 
 
197 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3469  galactoside-O-acetyltransferase  35.17 
 
 
202 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303917  decreased coverage  0.000594115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3624  hexapaptide repeat-containing transferase  42.15 
 
 
182 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  45.76 
 
 
192 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  38.26 
 
 
183 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  42.28 
 
 
204 aa  105  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  44.07 
 
 
175 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.64 
 
 
183 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.18 
 
 
187 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  43.22 
 
 
186 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  42.5 
 
 
183 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0703  Maltose O-acetyltransferase  36.69 
 
 
185 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998989  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  39.39 
 
 
187 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.39 
 
 
187 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  37.04 
 
 
193 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  41.03 
 
 
203 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  41.03 
 
 
203 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.03 
 
 
201 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2328  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
185 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  41.03 
 
 
203 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2942  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
185 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  41.03 
 
 
201 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  41.6 
 
 
192 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1126  galactoside-O-acetyltransferase  35.9 
 
 
198 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  37.86 
 
 
206 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  41.8 
 
 
184 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  38.24 
 
 
198 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  42.86 
 
 
190 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  38.24 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00030  maltose O-acetyltransferase, putative  40 
 
 
211 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2963  hexapaptide repeat-containing transferase  40.91 
 
 
185 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734679  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.22 
 
 
182 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1515  maltose O-acetyltransferase  32.65 
 
 
203 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00228608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2912  maltose transacetylase  38.24 
 
 
195 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.231486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1531  hexapaptide repeat-containing transferase  42.28 
 
 
184 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000154529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  35.76 
 
 
186 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2590  maltose transacetylase  37.14 
 
 
195 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  35.21 
 
 
186 aa  101  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2617  hexapaptide repeat-containing transferase  40.34 
 
 
194 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4253  Galactoside O-acetyltransferase  39.38 
 
 
198 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00506408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  35.76 
 
 
186 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1794  hexapaptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
198 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0954  maltose O-acetyltransferase  38.82 
 
 
183 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.186778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  41.79 
 
 
199 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2730  hexapaptide repeat-containing transferase  39.5 
 
 
194 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4917  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  34.91 
 
 
197 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3168  hexapaptide repeat-containing transferase  32.74 
 
 
203 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  100  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0767  nodulation protein L  45.45 
 
 
199 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.55437  hitchhiker  0.000000843349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1730  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.5 
 
 
195 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
185 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0483  maltose O-acetyltransferase  34.31 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.833227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0549  maltose O-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.299767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>