More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0688 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  51.14 
 
 
208 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0424  acetyltransferase  47.8 
 
 
204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.732254  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2092  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.47 
 
 
179 aa  155  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  46.63 
 
 
185 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  42.54 
 
 
187 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  44.51 
 
 
183 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6296  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.86 
 
 
184 aa  141  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2547  putative acetyltransferase  39.16 
 
 
185 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  41.22 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.54 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.54 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  41.22 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.54 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.54 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.86 
 
 
182 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.54 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.86 
 
 
182 aa  124  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02945  putative acetyltransferase  35.58 
 
 
186 aa  121  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.67 
 
 
184 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.67 
 
 
184 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  41.67 
 
 
184 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2343  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.97 
 
 
184 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2292  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.97 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  0.020908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5855  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  35.29 
 
 
206 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1176  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.75 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0907  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  37.18 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00617955  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3435  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.14 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.248973  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1424  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.65 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1453  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  36.65 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4533  hexapaptide repeat-containing transferase  36.48 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7375  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  40.79 
 
 
184 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3876  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  34.34 
 
 
187 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0327816  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4965  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  39.35 
 
 
192 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2752  hexapaptide repeat-containing transferase  38.64 
 
 
192 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733742  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0251  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.76 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  33.82 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2466  acetyltransferase  35.16 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.69192  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2591  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.01 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05770  hypothetical protein  28.22 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  34.06 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13761  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  29.68 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2602  acetyltransferase-like protein  39.84 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4278  acetyltransferase  29.73 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298738  hitchhiker  0.0000105124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  29.07 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1829  acetyltransferase-like protein  33.55 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3858  hypothetical protein  35.29 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0826  hypothetical protein  34.56 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  33.8 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2374  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  26.99 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  30.07 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  33.58 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  30.66 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  35.24 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0766  nodulation protein L  34.03 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352281  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3538  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  27.57 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  30.41 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  32.85 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  35.24 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  26.83 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0578  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.03 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.566139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3310  hexapaptide repeat-containing transferase  27.03 
 
 
273 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342326  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3219  hexapaptide repeat-containing transferase  33.04 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.282397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  39.5 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  25.37 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  33.9 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.39 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  39.39 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  28.97 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  27.01 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  36.61 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4516  maltose O-acetyltransferase protein  30.99 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17584  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  31.58 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  31.69 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  24.65 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  25 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  25.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.55 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  25.35 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  25.55 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.75 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  25.55 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  30.84 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  31.09 
 
 
186 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  27.91 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  23.75 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  31.67 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  27.65 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0522  maltose O-acetyltransferase  34.09 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00115683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0575  maltose O-acetyltransferase  34.09 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00855967  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  26.45 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.37 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  28.95 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2286  galactoside O-acetyltransferase 1; maltose O-acetyltransferase 1  27.98 
 
 
303 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  23.73 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0793  acetyltransferase  33.58 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  28.95 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  34.13 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  23.7 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>