74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0825 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  41.75 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  38.25 
 
 
250 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  37.76 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  39.18 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.01 
 
 
210 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.01 
 
 
210 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.01 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.01 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.01 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  32.69 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  33.49 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  32.54 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  32.54 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  32.06 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  31.25 
 
 
210 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  35.07 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  35.07 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  27.45 
 
 
316 aa  67  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  30.22 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  26.87 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  29.45 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  29.01 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  23.74 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  31.82 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  32.33 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  26.37 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  26.64 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  32.33 
 
 
282 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  31.03 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  25.58 
 
 
187 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  32.84 
 
 
268 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.16 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  32.58 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.75 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  27.85 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  24.81 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.65 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.68 
 
 
344 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  26.56 
 
 
337 aa  55.5  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  24.68 
 
 
365 aa  53.9  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  24.44 
 
 
377 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.22 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  24.09 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  28.57 
 
 
381 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  30.48 
 
 
302 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  32.45 
 
 
395 aa  52.4  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  32.58 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.91 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  27.13 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  28.67 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.91 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  23.74 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0714  sortase (surface protein transpeptidase)  30.5 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0029312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  25.29 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  27.78 
 
 
291 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  25 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  22.37 
 
 
268 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.24 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  25 
 
 
324 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1128  sortase (surface protein transpeptidase)  28.79 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.513672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  24.08 
 
 
384 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  34.52 
 
 
354 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  28.83 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  31.09 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  27.27 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1443  sortase (surface protein transpeptidase)  25.9 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  22.22 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  22.22 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  25.14 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.53 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  23.59 
 
 
323 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  26.71 
 
 
249 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  26.32 
 
 
189 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>