23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0714 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0714  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 
331 aa  685    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0029312  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1443  sortase (surface protein transpeptidase)  41.58 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  29.58 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  27.52 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  26.47 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  29.93 
 
 
203 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.27 
 
 
210 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  28.68 
 
 
210 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  30.5 
 
 
229 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.97 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  24.09 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.47 
 
 
210 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.47 
 
 
210 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  28.82 
 
 
253 aa  47  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.47 
 
 
210 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.47 
 
 
210 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  25.43 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  25.43 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  25.32 
 
 
210 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  26.47 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  28.95 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  28.29 
 
 
265 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>