More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0515 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0515  amino acid transporter  100 
 
 		 469 aa  934    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000710149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0390  amino acid permease-associated region  58.93 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000972649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1791  amino acid transporter  56.99 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000626073  hitchhiker  3.07012e-24 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2340  amino acid permease-associated region  58.08 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000488972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2383  amino acid permease-associated region  58.08 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  56.29 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1790  amino acid transporter  58.48 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000013826  hitchhiker  2.2077400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1902  amino acid permease  57.95 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3176  amino acid permease  56.2 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000126504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0960  amino acid permease-associated region  59.69 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000121787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  56.68 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3471  amino acid permease  55.98 
 
 		 472 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0414864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3490  amino acid permease family protein  56.25 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.175253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3262  amino acid permease family protein  56.2 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000532253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3234  amino acid permease  55.98 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.42429e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  56.25 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3168  amino acid permease-associated region  55.82 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.206651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3516  amino acid permease family protein  56.47 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3477  amino acid permease family protein  56.25 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  52.69 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  52.47 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  52.69 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  51.66 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  51.29 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  52.38 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03623  hypothetical protein  52.22 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000382279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03674  predicted transporter  52.22 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000431202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4014  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.1864e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4180  amino acid permease-associated region  52.22 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000115482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4259  putative transport protein YifK  53.66 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000481193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4210  putative transport protein YifK  53.66 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000256233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4141  putative transport protein YifK  53.66 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000118516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4125  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4309  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000528729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4160  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000124284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4207  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000449535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5229  putative transport protein YifK  52.22 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000882979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4156  putative transport protein YifK  53.66 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000110979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  53.22 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0213  putative transport protein YifK  49.24 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0168  putative transport protein YifK  49.68 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00228239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  45.49 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  44.75 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  45.77 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  43.66 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  43.87 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  43.56 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  43.56 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  43.56 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  43.56 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  43.56 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  43.66 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  43.44 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  47.34 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  43.01 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 459 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  42.76 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  42.98 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  42.98 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  43.67 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  42.54 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  44.66 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  43.02 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  43.02 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  43.02 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  43.66 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  43.23 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  43.44 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  44.01 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  43.01 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  41.13 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  40.69 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 475 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  42.42 
 
 		 467 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  40.95 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 452 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  41.09 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  41.09 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  41.09 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  41.09 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  41.36 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  41.36 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  41.72 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  41.36 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  40.52 
 
 		 459 aa  340  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  40.65 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  38.71 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>