More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2476 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2476  transcriptional regulator  100 
 
 		 87 aa  179  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000150722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  63.53 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  60.24 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  58.33 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  56.98 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  57.14 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  53.25 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  53.57 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  57.53 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  51.25 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  54.43 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  53.75 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  51.72 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  52.44 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  52.5 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  54.67 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  56 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.81 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50.63 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.78 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  53.52 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  51.81 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  66.13 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  55.84 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  55.84 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  50.6 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  50.6 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  50.6 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  50.6 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  50.6 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  50.6 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  52 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  50.7 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  50.6 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  51.39 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  52.5 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  46.75 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.84 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  48.78 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  52.56 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  52.11 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  52.11 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  52.11 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  49.33 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  48.72 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  55.22 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  50.63 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.57 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  42.5 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  55.13 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  50.7 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  46.05 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  56.06 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  53.03 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  52.86 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  48.05 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>