More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0086 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0086  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
419 aa  837    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1202  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  59.16 
 
 
404 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401945  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2894  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  56.37 
 
 
414 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3492  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  58.92 
 
 
414 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2863  RNA SAM-dependent methyltransferase  59.41 
 
 
404 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2640  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  58.27 
 
 
404 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.365199  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2577  (Uracil-5)-methyltransferase  55.22 
 
 
406 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.749206  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0783  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  49.26 
 
 
415 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  0.392403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4164  putative RNA methyltransferase  44.94 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0490  (Uracil-5)-methyltransferase  43.49 
 
 
420 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0549  (Uracil-5)-methyltransferase  41.29 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.835244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0445  RNA methyltransferase  40.74 
 
 
415 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504285  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0438  RNA methyltransferase  40.74 
 
 
415 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2157  (Uracil-5)-methyltransferase  42.34 
 
 
408 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0223783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0737  (Uracil-5)-methyltransferase  41.83 
 
 
413 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2835  (uracil-5)-methyltransferase  43.45 
 
 
421 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2376  (Uracil-5)-methyltransferase  44.31 
 
 
420 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0603  (Uracil-5)-methyltransferase  40.1 
 
 
416 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0776  RNA methyltransferase  42.89 
 
 
414 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0991  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  40.19 
 
 
418 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0402  tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase  37.31 
 
 
417 aa  276  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1018  (Uracil-5)-methyltransferase  43.1 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0560  (Uracil-5)-methyltransferase  41.42 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1145  RNA methyltransferase  41.32 
 
 
412 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.930792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2476  putative RNA methyltransferase  43.07 
 
 
411 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0631  putative RNA methyltransferase  39.71 
 
 
422 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.597778  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1192  (Uracil-5)-methyltransferase  40.93 
 
 
399 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157421  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4829  (Uracil-5)-methyltransferase  40.71 
 
 
437 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.189642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4681  (Uracil-5)-methyltransferase  40.59 
 
 
431 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4312  (Uracil-5)-methyltransferase  40.59 
 
 
431 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.458896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4463  (Uracil-5)-methyltransferase  39.95 
 
 
412 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1814  putative RNA methyltransferase  41.79 
 
 
430 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4309  RNA methyltransferase  39.7 
 
 
412 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0719  putative RNA methyltransferase  40.43 
 
 
422 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3821  (uracil-5)-methyltransferase  41.89 
 
 
425 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178378  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4660  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.2 
 
 
405 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1787  (Uracil-5)-methyltransferase  39.62 
 
 
401 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3318  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.3 
 
 
426 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2107  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.86 
 
 
465 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0533  (Uracil-5)-methyltransferase  37.13 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.476297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.18 
 
 
463 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.95 
 
 
449 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.63 
 
 
455 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.95 
 
 
463 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  31.47 
 
 
424 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.16 
 
 
449 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.41 
 
 
443 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.33 
 
 
442 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  32.82 
 
 
446 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  30.42 
 
 
407 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.63 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.05 
 
 
445 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.14 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.63 
 
 
450 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.18 
 
 
443 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.63 
 
 
450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.86 
 
 
450 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.11 
 
 
444 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.45 
 
 
468 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  28.41 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3237  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.5 
 
 
431 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0193521  normal  0.0341148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.7 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  26.96 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.14 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  28.54 
 
 
459 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  28.54 
 
 
459 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  28.76 
 
 
459 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.7 
 
 
450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0344  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.57 
 
 
512 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0378  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.46 
 
 
513 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0129185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  28.67 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0529  RNA methyltransferase, TrmA family protein  27.79 
 
 
444 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101242  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  28.22 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  28.22 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.22 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.22 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  30.31 
 
 
440 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  29.67 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.67 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.67 
 
 
433 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  27.71 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  29.67 
 
 
433 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.22 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2923  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.44 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164007  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.43 
 
 
433 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.43 
 
 
433 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.93 
 
 
439 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  28.44 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  27.85 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1572  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.69 
 
 
444 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.77 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.67 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1412  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.23 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4116  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase  28.35 
 
 
469 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.08 
 
 
449 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.68 
 
 
449 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.97 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.11 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.09 
 
 
445 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  27.71 
 
 
459 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>