More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3745 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3745  ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.955368  normal  0.405047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  55.05 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  55.66 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1905  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1990  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1973  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  53.77 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  56.48 
 
 		 116 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  51.89 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  48.28 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  48.7 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  50.45 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  48.65 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1882  50S ribosomal protein L20  50.96 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96166  normal  0.0688359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0027  50S ribosomal protein L20  50.44 
 
 		 114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  50.45 
 
 		 119 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  46.96 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  47.83 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  48.67 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  51.38 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  46.55 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0153  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.285094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  48.28 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00830  50S ribosomal protein L20  48.67 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.892905  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  46.55 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1909  ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  46.09 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  49.06 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1224  ribosomal protein L20  46.02 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00301137  hitchhiker  0.00307166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  50.94 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  53.77 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  46.55 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2355  50S ribosomal protein L20  46.36 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.030925  normal  0.100889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  49.55 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  46.36 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2674  50S ribosomal protein L20  51.96 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.36852 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  48.65 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  46.96 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  45.69 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2504  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0173  50S ribosomal protein L20  46.49 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1191  50S ribosomal protein L20  44.92 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0989  50S ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  48.11 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  46.61 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  45.76 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  48.25 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  47.75 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  44.83 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  44.07 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  48.65 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0995  ribosomal protein L20  46.9 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4269  50S ribosomal protein L20  45.05 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  44.07 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>