More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1882 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1882  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 114 aa  216  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96166  normal  0.0688359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1973  50S ribosomal protein L20  88.6 
 
 		 114 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1905  50S ribosomal protein L20  87.72 
 
 		 114 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1990  50S ribosomal protein L20  87.72 
 
 		 114 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  66.37 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 117 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  66.35 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  66.35 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  56.36 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  60.71 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  61.61 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  60.71 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  123  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  60.71 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  58.93 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  61.06 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  56.25 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  54.87 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>