More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1905 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1990  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
114 aa  220  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1905  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
114 aa  220  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1973  50S ribosomal protein L20  99.12 
 
 
114 aa  219  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1882  50S ribosomal protein L20  89.52 
 
 
114 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96166  normal  0.0688359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 
117 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  63.72 
 
 
117 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 
118 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  61.95 
 
 
117 aa  143  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 
117 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  65.38 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  65.38 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  55.75 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
118 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
133 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  53.98 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0865  50S ribosomal protein L20  53.1 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  50.89 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
117 aa  124  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 
117 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
118 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  53.57 
 
 
119 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
118 aa  123  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3745  ribosomal protein L20  51.33 
 
 
118 aa  123  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.955368  normal  0.405047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  53.1 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  123  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
119 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
118 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 
125 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
119 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  59.29 
 
 
119 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 
121 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 
117 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  57.14 
 
 
118 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  58.41 
 
 
119 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
119 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
118 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
118 aa  120  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  56.64 
 
 
117 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
118 aa  120  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  57.52 
 
 
119 aa  120  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
117 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
119 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1163  ribosomal protein L20  53.7 
 
 
114 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000242027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  58.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2216  ribosomal protein L20  58.42 
 
 
114 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
117 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
120 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
119 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
119 aa  120  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  56.25 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  53.57 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3092  50S ribosomal protein L20  56.64 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.907981  normal  0.0375631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  53.98 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.75 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>