More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4914 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4914  ribosomal protein S10  100 
 
 
77 aa  157  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0255931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  92.21 
 
 
102 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  90.91 
 
 
102 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  89.61 
 
 
102 aa  144  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  76.62 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  71.43 
 
 
102 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  71.43 
 
 
102 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  70.13 
 
 
102 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  70.13 
 
 
102 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  70.13 
 
 
102 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  68.83 
 
 
102 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  68.83 
 
 
102 aa  120  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  68.83 
 
 
102 aa  120  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  68.83 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  68.83 
 
 
102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  68.42 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  71.05 
 
 
108 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  71.43 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  68.42 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  69.33 
 
 
102 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  67.57 
 
 
103 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  65.79 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  65.79 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  65.79 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  65.79 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  66.23 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
102 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  64.47 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  67.53 
 
 
102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  62.34 
 
 
107 aa  114  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
102 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  65.33 
 
 
103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  62.34 
 
 
101 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  67.11 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  64.94 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  62.34 
 
 
102 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  61.04 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>