More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0368 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  607  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
300 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  39.36 
 
 
282 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
309 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  38.28 
 
 
279 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26300  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.56 
 
 
293 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  36.65 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
299 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  38.25 
 
 
283 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  36.63 
 
 
270 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
373 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
299 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3007  nickel transporter permease NikC  39.67 
 
 
281 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.524853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.83 
 
 
282 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
301 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1442  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
276 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.100429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
276 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0117568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2599  binding-protein-dependent transport system permease  42.68 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0325086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  37.34 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  34.88 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0788732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.71 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
296 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6074  nickel transporter permease NikC  38.52 
 
 
283 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 
292 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  36.63 
 
 
290 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
304 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  35.8 
 
 
284 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
310 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
287 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.96 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.96 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.96 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.96 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.96 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.03 
 
 
289 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
296 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
295 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
273 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.78 
 
 
296 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
294 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
292 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273251  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
305 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
311 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5257  putative ABC transporter (permease protein)  35.52 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216925  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.75 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.163577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.870521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  38.87 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  36.26 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
300 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
311 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
298 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.43 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0952  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.89 
 
 
284 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0427194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  38.59 
 
 
286 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
309 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.805329  normal  0.0512458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.91 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.36 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.91 
 
 
303 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.91 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
288 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.91 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
299 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.450042  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1099  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.2 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.46 
 
 
303 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
303 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  39.46 
 
 
303 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
300 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
307 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
300 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5120  putative ABC transporter permease protein  38.17 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.30642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.33 
 
 
306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
300 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
303 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
298 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  37.6 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>