252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0738 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0738  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0779144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  43.52 
 
 
197 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  43.01 
 
 
197 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  174  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  41.97 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.97 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.45 
 
 
196 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  40.93 
 
 
196 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  43.3 
 
 
197 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  40.93 
 
 
197 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 
197 aa  168  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 
195 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  43.46 
 
 
196 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  40.31 
 
 
196 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  40.31 
 
 
196 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  39.79 
 
 
196 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1175  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  42.86 
 
 
195 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.853974  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  35.08 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  35.6 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  35.6 
 
 
195 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  35.6 
 
 
197 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  35.6 
 
 
197 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  35.6 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
197 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
197 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
199 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  34.92 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  35.08 
 
 
197 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  33.68 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  32.64 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  36.61 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2921  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3064  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  31.94 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3147  phosphoheptose isomerase  32.81 
 
 
194 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  29.53 
 
 
197 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  32.63 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  30.73 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  31.09 
 
 
197 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  33.16 
 
 
195 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  30.05 
 
 
200 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  27.87 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  30.05 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  30.89 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  28.42 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  32.32 
 
 
358 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  32.32 
 
 
358 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  30.73 
 
 
197 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  31.95 
 
 
189 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1063  phosphoheptose isomerase  29.95 
 
 
202 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0407  phosphoheptose isomerase  29.9 
 
 
197 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.763268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  32.4 
 
 
197 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  30.36 
 
 
212 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3392  phosphoheptose isomerase  30.41 
 
 
194 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  29.63 
 
 
189 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  31.93 
 
 
189 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  30 
 
 
194 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  32.91 
 
 
189 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  30.89 
 
 
192 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0203  phosphoheptose isomerase  28.27 
 
 
194 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  33.14 
 
 
192 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  31.11 
 
 
195 aa  101  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>