More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3773 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3773  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.49 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 
267 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
264 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
262 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
264 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
267 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6663  enoyl-CoA hydratase  38.39 
 
 
253 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
266 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0176  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
248 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12507  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
256 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.8945800000000003e-40  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
259 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
263 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2497  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.92 
 
 
255 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
260 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
262 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
267 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
260 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
269 aa  101  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
257 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
271 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
270 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
260 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
260 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4083  enoyl-CoA hydratase  35.65 
 
 
250 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00898216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
255 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
273 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
274 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.65 
 
 
280 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  31.96 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
267 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.95 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
287 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
262 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.15 
 
 
264 aa  95.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3696  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592962  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.81 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.76 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
279 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3623  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0079927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3628  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
260 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  33.67 
 
 
263 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 
266 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
259 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4597  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
269 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
269 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
269 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.13 
 
 
255 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  26.51 
 
 
262 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>