More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0908 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3773  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.49 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0176  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 
248 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4083  enoyl-CoA hydratase  40.11 
 
 
250 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00898216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3623  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0079927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3696  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12507  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.8945800000000003e-40  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3628  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 
259 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6663  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
253 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
270 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2557  enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2497  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  31.36 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
271 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.1 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.27 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  26.38 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  27.87 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 
262 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  28.43 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
259 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  33.51 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.22 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.64 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  29.96 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.42 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  28.75 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  27.45 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.86 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.86 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.85 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  32.86 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  28.75 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.76 
 
 
256 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  25.42 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.84 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.87 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.82 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  28.14 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4116  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  27.69 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.79 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.79 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  26.81 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  30.18 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.99 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3234  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.37 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.85 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.89 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.85 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  32.46 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  27.6 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.7 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54494  enoyl-coa hydratase  28.64 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.963819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  28.08 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>