115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2661 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  100 
 
 		 534 aa  1077    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  98.67 
 
 		 532 aa  969    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  72.01 
 
 		 567 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  57.28 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  56.9 
 
 		 529 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  58.46 
 
 		 549 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  59.44 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  59.44 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  59.44 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  57.55 
 
 		 562 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  49.14 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  51.43 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  49.71 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  41.6 
 
 		 522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  45.04 
 
 		 558 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  38.76 
 
 		 545 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.31 
 
 		 596 aa  296  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  37.79 
 
 		 539 aa  296  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  40.34 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  38.54 
 
 		 567 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  40.94 
 
 		 605 aa  289  7e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  39.88 
 
 		 598 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  37.63 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  37.63 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  37.63 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  37.7 
 
 		 527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  36.76 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  36.01 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.76 
 
 		 578 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  34.09 
 
 		 569 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  36.47 
 
 		 572 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  37.77 
 
 		 532 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  38.86 
 
 		 603 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  35.82 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  39.6 
 
 		 544 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  38.01 
 
 		 704 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  35.62 
 
 		 563 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  36.35 
 
 		 565 aa  243  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  38.34 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  36.4 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  37.57 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  34.86 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  32.52 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.28 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.31 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.94 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.41 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  24.36 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  28.03 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  21.07 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  26.18 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  25.52 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  23.73 
 
 		 725 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  23.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  24.91 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  23.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  23.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  23.73 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  23.73 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.83 
 
 		 453 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.23 
 
 		 670 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  23.25 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  23.25 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.97 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  23.25 
 
 		 737 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  23.81 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  23.81 
 
 		 738 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  22.61 
 
 		 738 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.08 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  24.27 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  22.68 
 
 		 738 aa  57  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  24.77 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.96 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  21.63 
 
 		 739 aa  55.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  26.33 
 
 		 733 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  24.27 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  26.32 
 
 		 679 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  26.63 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.98 
 
 		 428 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  25.6 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  22.36 
 
 		 742 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  23.72 
 
 		 734 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24.45 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  25.14 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  23.72 
 
 		 734 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  23.63 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.33 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  21.52 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  24.84 
 
 		 750 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  26.23 
 
 		 542 aa  50.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.61 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  25.14 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  25 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  23.2 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  21.72 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  22.95 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  22.65 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.53 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  24.67 
 
 		 452 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  22.82 
 
 		 452 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>