133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2201 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  100 
 
 		 532 aa  1068    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  47.25 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.28 
 
 		 596 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  46.72 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  44.65 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  44.65 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  44.65 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  43.64 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  42.77 
 
 		 569 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  44.68 
 
 		 572 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  43.39 
 
 		 576 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  42.77 
 
 		 567 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  43.45 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  46.85 
 
 		 603 aa  350  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  42.23 
 
 		 558 aa  349  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  43.06 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  43.39 
 
 		 578 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  45.13 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  46.77 
 
 		 538 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  42.59 
 
 		 532 aa  329  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  41.04 
 
 		 560 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  44.81 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.38 
 
 		 565 aa  310  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  38.76 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  40.04 
 
 		 522 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  40.28 
 
 		 563 aa  299  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  37.68 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  35.54 
 
 		 550 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  35.84 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  39.92 
 
 		 704 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  39.68 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  40 
 
 		 545 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  40.04 
 
 		 539 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  43 
 
 		 558 aa  269  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  38.72 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  38.72 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  38.72 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.45 
 
 		 548 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  38.83 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  37.79 
 
 		 562 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  37.98 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  37.57 
 
 		 534 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  37.92 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  21.71 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.92 
 
 		 423 aa  90.9  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.13 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  25 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.46 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  23.59 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.22 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  27.42 
 
 		 738 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  24.54 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.68 
 
 		 670 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  26.91 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.3 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  23.49 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  23.49 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.35 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.62 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  23.24 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.08 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  28.25 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  28.25 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  22.46 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  29.78 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  27.42 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  27.42 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  29.78 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  29.78 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  29.78 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  29.78 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  29.78 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  27.42 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  24.71 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.18 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  25.97 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  25.37 
 
 		 733 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  28.49 
 
 		 738 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  24.68 
 
 		 741 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  24.14 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  28.89 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  23.37 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  25 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.56 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.96 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.22 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  27.51 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  22.93 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  23.35 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  28.65 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.1 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  23.84 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.05 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  23.91 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.88 
 
 		 454 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  26.86 
 
 		 678 aa  57  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.11 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  24.75 
 
 		 660 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  25.62 
 
 		 727 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>