132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3290 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  71.85 
 
 		 550 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  71.85 
 
 		 550 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  71.85 
 
 		 550 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  100 
 
 		 576 aa  1167    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  86.09 
 
 		 588 aa  922    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  58.21 
 
 		 565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  45.87 
 
 		 569 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  47.13 
 
 		 596 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  45.66 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  45.67 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  45.08 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  46.21 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  45.31 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  44.68 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  46.98 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  43.42 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  46.64 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  44.6 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.01 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  43.55 
 
 		 532 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  43.24 
 
 		 560 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  44.16 
 
 		 603 aa  347  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  43.39 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  40.2 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  37.43 
 
 		 540 aa  310  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  39.21 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  39.55 
 
 		 573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  37.94 
 
 		 704 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  36.6 
 
 		 550 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  39.03 
 
 		 539 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  37.92 
 
 		 545 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.06 
 
 		 548 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  37.11 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  36.29 
 
 		 529 aa  276  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  37.86 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  38.22 
 
 		 536 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  38.22 
 
 		 536 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  38.22 
 
 		 536 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  38.13 
 
 		 567 aa  263  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  39.84 
 
 		 558 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  36.19 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  36.44 
 
 		 534 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  35.42 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  27.96 
 
 		 737 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  27.96 
 
 		 737 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  27.69 
 
 		 737 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  28.25 
 
 		 738 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  27.67 
 
 		 719 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  25.99 
 
 		 741 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  29.28 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  29.28 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  29.28 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  29.28 
 
 		 725 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  29.28 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  29.28 
 
 		 725 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  25.63 
 
 		 740 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  25.63 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  26.18 
 
 		 733 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  26.33 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  25 
 
 		 750 aa  83.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  26.35 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  24.32 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  26.21 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  24.32 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.89 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.53 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  25.39 
 
 		 694 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  24.11 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  26.63 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  23.01 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  24.77 
 
 		 679 aa  77  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.18 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.21 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  23.22 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.5 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  28.42 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  28.91 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.28 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  20.42 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.73 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  24.21 
 
 		 734 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  24.84 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  24.21 
 
 		 734 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  29.21 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  29.21 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  23.23 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  29.21 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.92 
 
 		 670 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.4 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  25.42 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  29.21 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  25.59 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  28.65 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  25.16 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  28.65 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  28.65 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  28.65 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.83 
 
 		 472 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  24.68 
 
 		 727 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  28.65 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>