131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0360 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  59.32 
 
 
700 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  57.95 
 
 
733 aa  847    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  85.59 
 
 
718 aa  1249    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  95.93 
 
 
738 aa  1393    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  49.58 
 
 
717 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  85.01 
 
 
719 aa  1255    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  47.36 
 
 
739 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  74.68 
 
 
740 aa  1117    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  58.12 
 
 
750 aa  843    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  99.73 
 
 
737 aa  1501    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  59.29 
 
 
734 aa  830    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  94.32 
 
 
740 aa  1390    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  99.73 
 
 
737 aa  1501    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  48.48 
 
 
732 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  47.07 
 
 
742 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  49.29 
 
 
717 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  85.59 
 
 
718 aa  1249    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  48.28 
 
 
724 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  47.73 
 
 
679 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  85.59 
 
 
718 aa  1249    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  85.88 
 
 
725 aa  1263    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  85.59 
 
 
718 aa  1249    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  85.88 
 
 
725 aa  1263    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  48.54 
 
 
727 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  93.5 
 
 
738 aa  1348    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  100 
 
 
737 aa  1504    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  94.72 
 
 
738 aa  1376    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  74.49 
 
 
741 aa  1127    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  73.37 
 
 
737 aa  1123    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  59.63 
 
 
734 aa  832    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  47.89 
 
 
722 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  42.03 
 
 
670 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  42.05 
 
 
694 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  41.06 
 
 
660 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  34.21 
 
 
679 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  33.71 
 
 
678 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  34.35 
 
 
700 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  33.33 
 
 
701 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  30.12 
 
 
664 aa  353  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  34.53 
 
 
614 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  34.53 
 
 
614 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  29.47 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.2 
 
 
457 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  28.06 
 
 
453 aa  111  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  26.39 
 
 
454 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  28.57 
 
 
454 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  26.07 
 
 
452 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  27.68 
 
 
452 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.98 
 
 
423 aa  98.6  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  26.01 
 
 
461 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.55 
 
 
455 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  23.47 
 
 
535 aa  95.5  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.9 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  23.87 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  24.93 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.68 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  24.44 
 
 
554 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.93 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  23.81 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  23.81 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  24.77 
 
 
511 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.33 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.62 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.16 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  28.09 
 
 
539 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.69 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.92 
 
 
596 aa  73.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.01 
 
 
426 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.35 
 
 
428 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  24.17 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  23.55 
 
 
522 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  22.44 
 
 
553 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.21 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  26.15 
 
 
588 aa  72  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.08 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.8 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  27.08 
 
 
576 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  22.64 
 
 
434 aa  70.5  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  24.23 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  25.93 
 
 
545 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  23.8 
 
 
456 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.81 
 
 
426 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  24.42 
 
 
550 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  24.42 
 
 
550 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  24.42 
 
 
550 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  24.87 
 
 
448 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  29.35 
 
 
336 aa  61.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  28.18 
 
 
558 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  22.93 
 
 
540 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  23.45 
 
 
484 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  18.81 
 
 
542 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  24.63 
 
 
567 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.3 
 
 
578 aa  58.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  22.22 
 
 
541 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  30.83 
 
 
1045 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  21.67 
 
 
538 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  22.22 
 
 
541 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  22.22 
 
 
541 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  27.42 
 
 
532 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.15 
 
 
548 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>