98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6118 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  100 
 
 		 563 aa  1133    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  70.2 
 
 		 704 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  46.9 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  42.44 
 
 		 522 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  41.38 
 
 		 527 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  45.84 
 
 		 544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  41.2 
 
 		 596 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  40.3 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  40.2 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  39.58 
 
 		 550 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  37.23 
 
 		 540 aa  309  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  41.83 
 
 		 560 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  40.94 
 
 		 572 aa  306  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  41.04 
 
 		 539 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  42.02 
 
 		 545 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  36.52 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  36.35 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  40.28 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  37.87 
 
 		 529 aa  299  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  36.43 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  36.43 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  36.43 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  38.9 
 
 		 532 aa  296  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  40.97 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  38.63 
 
 		 569 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  40.15 
 
 		 578 aa  292  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  37.43 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  38.99 
 
 		 558 aa  289  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  38.77 
 
 		 549 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  42.77 
 
 		 558 aa  283  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  39.08 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  39.08 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  39.08 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  39.03 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  37.61 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  39.15 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.73 
 
 		 565 aa  270  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  37.82 
 
 		 562 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  35.56 
 
 		 548 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  38.96 
 
 		 567 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  35.5 
 
 		 534 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  35.31 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  34.55 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  26.43 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.33 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  21.43 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.27 
 
 		 670 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  26.05 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  25.54 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.86 
 
 		 428 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.71 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  27.46 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.22 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  24.12 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  24.12 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  22.7 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  24.74 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.98 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  22.7 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  23.57 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  26.45 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.89 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.54 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  23.53 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  22.62 
 
 		 694 aa  57  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  22.58 
 
 		 701 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.22 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.34 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  21.64 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  23.08 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.12 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.22 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24.48 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.61 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  23.94 
 
 		 454 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  23.47 
 
 		 456 aa  53.5  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  23.49 
 
 		 679 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  26.54 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  22.65 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.79 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  21.82 
 
 		 459 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  24.14 
 
 		 750 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  20.58 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  23.09 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  22.91 
 
 		 733 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  23.29 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  25.81 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  22.73 
 
 		 678 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  36.07 
 
 		 336 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  23.05 
 
 		 679 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  22.94 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  23.34 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.09 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  23.45 
 
 		 535 aa  45.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  23.32 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2870  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  23.42 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1520  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  30.97 
 
 		 342 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>