144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3842 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  100 
 
 
453 aa  931    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  67.55 
 
 
452 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  67.99 
 
 
452 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  65.05 
 
 
452 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  65.71 
 
 
454 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  52.11 
 
 
454 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  51.73 
 
 
455 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  41.87 
 
 
461 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  37.75 
 
 
457 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  35.05 
 
 
457 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  35.78 
 
 
458 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  30.67 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  28.66 
 
 
457 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  28.48 
 
 
535 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  27.6 
 
 
434 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  27.33 
 
 
423 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  24.85 
 
 
554 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  24.63 
 
 
553 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  23.53 
 
 
542 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  22.83 
 
 
538 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  23.03 
 
 
541 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  23.14 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  23.14 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  23.14 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  23.58 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  23.54 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  29.08 
 
 
719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  23.17 
 
 
541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  23.23 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  28.76 
 
 
718 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  28.76 
 
 
725 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  28.76 
 
 
718 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  28.76 
 
 
718 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  28.76 
 
 
718 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  28.76 
 
 
725 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  27.71 
 
 
738 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  27.63 
 
 
737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  26.92 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  27.63 
 
 
737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  27.63 
 
 
737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  28.43 
 
 
740 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  28.43 
 
 
738 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  22.36 
 
 
541 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  28.61 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  27.87 
 
 
429 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25.62 
 
 
457 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  26.23 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.94 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25.95 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  25.18 
 
 
741 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  27.83 
 
 
737 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  27.83 
 
 
740 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.56 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  25.55 
 
 
679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  27.08 
 
 
660 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  26.18 
 
 
701 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.64 
 
 
459 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.51 
 
 
426 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25 
 
 
426 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  31.74 
 
 
511 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.95 
 
 
429 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  24.64 
 
 
614 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  24.64 
 
 
614 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  25.58 
 
 
395 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.23 
 
 
428 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.31 
 
 
670 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  24.28 
 
 
678 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  26.71 
 
 
733 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.53 
 
 
428 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  24.6 
 
 
742 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.96 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  25.08 
 
 
734 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.84 
 
 
426 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  24.47 
 
 
540 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  26.77 
 
 
700 aa  94  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  25.08 
 
 
734 aa  93.2  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  28.71 
 
 
664 aa  91.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  27.24 
 
 
750 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.67 
 
 
472 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  25.69 
 
 
446 aa  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  24.08 
 
 
679 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  24.04 
 
 
694 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  25.31 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  21.63 
 
 
522 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  23.47 
 
 
739 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.84 
 
 
432 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  25.38 
 
 
717 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  25.83 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.27 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  24.26 
 
 
717 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  23.56 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  22.18 
 
 
603 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  20.99 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  21.11 
 
 
724 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  23.93 
 
 
727 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  24.9 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  24.9 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  24.9 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  23.02 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  25.09 
 
 
558 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>