118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2702 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  100 
 
 		 527 aa  1066    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  63.67 
 
 		 567 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  52.87 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  48.6 
 
 		 560 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  49.62 
 
 		 538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  45.02 
 
 		 576 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  49.19 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  44.74 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  43.94 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  43.94 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  43.94 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  44.75 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  43.94 
 
 		 605 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  43.84 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  42.86 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  43.13 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  43.25 
 
 		 545 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  42.3 
 
 		 518 aa  349  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  42.72 
 
 		 532 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  42.94 
 
 		 558 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  43.91 
 
 		 539 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  44.6 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.8 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  43.03 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  43.31 
 
 		 704 aa  336  7.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  39.47 
 
 		 550 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  39.49 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  38.63 
 
 		 540 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  40.87 
 
 		 532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  43.15 
 
 		 598 aa  309  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  38.94 
 
 		 548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  39.73 
 
 		 529 aa  296  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  43.66 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  39.39 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  40.68 
 
 		 567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.34 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  38.32 
 
 		 562 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  39.84 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  39.84 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  39.84 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  38.43 
 
 		 573 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  37.7 
 
 		 534 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  37.84 
 
 		 532 aa  260  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.77 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  24.08 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.27 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  26.09 
 
 		 700 aa  76.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.85 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  23.32 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  23.86 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.73 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.62 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.68 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.52 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  23.79 
 
 		 694 aa  63.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.62 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  18.98 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.48 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  20.96 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  20.96 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  24.06 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.83 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  22.58 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  25.44 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  18.5 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  20.82 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  22.64 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  22.91 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  25 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  23.44 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  26.14 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.35 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  29.59 
 
 		 679 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  25.83 
 
 		 734 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  18.7 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  23.81 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  21.3 
 
 		 452 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  24.76 
 
 		 738 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.45 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  24.83 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  25.08 
 
 		 737 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  25.08 
 
 		 737 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  23.55 
 
 		 678 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  25.08 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  20.91 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.35 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  24.43 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  24.43 
 
 		 738 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  25.51 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  25.5 
 
 		 734 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  24.25 
 
 		 740 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  24.46 
 
 		 717 aa  50.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  24.46 
 
 		 717 aa  50.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  23.83 
 
 		 448 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0572  hypothetical protein  24.73 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.74 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.88 
 
 		 737 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  24.5 
 
 		 701 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  24.12 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.81 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>