24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0572 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  893    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0592  hypothetical protein  42.69 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  40.18 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  38.57 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  39.68 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  20.61 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  21.49 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  21.08 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  22.61 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.64 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.53 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.46 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  25 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  19.51 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  22.33 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  24.75 
 
 		 567 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  22.98 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  25.27 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  22.36 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  22.76 
 
 		 588 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  22.74 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  22.74 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  22.74 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  18.12 
 
 		 535 aa  43.1  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>