51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2891 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  859    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0592  hypothetical protein  56.93 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0572  hypothetical protein  38.57 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  36.1 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  36.32 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  27.88 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2870  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3557  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  23.56 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  25.77 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  29.28 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  25.61 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  27.47 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  24.92 
 
 		 536 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  24.92 
 
 		 536 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  24.92 
 
 		 536 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.88 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  25.23 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.27 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  26.71 
 
 		 549 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  21.51 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  24.03 
 
 		 542 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  26.36 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  26.85 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  26.85 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  24.92 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  25.53 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  25.08 
 
 		 532 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.21 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  20.77 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  26.07 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  26.13 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  17.78 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  23.7 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  31.48 
 
 		 538 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  24.81 
 
 		 532 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  23.74 
 
 		 540 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.73 
 
 		 596 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  22.71 
 
 		 740 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  25.29 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  26.51 
 
 		 532 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  22.58 
 
 		 737 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  22.4 
 
 		 738 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  22.58 
 
 		 737 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  22.58 
 
 		 737 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  25.2 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.81 
 
 		 670 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  25.46 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  23.66 
 
 		 719 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  20.14 
 
 		 535 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  22.3 
 
 		 740 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>