57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0522 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  100 
 
 		 437 aa  895    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0592  hypothetical protein  41.88 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0572  hypothetical protein  40.18 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  36.1 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  37.58 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  25.36 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  24.11 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.09 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  22.46 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  24.18 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  22.95 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  22.51 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  21.09 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  20.86 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.76 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  20.35 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  25.95 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  20.82 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  21.73 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  20.23 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  22.22 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  25.17 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  21.85 
 
 		 459 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.22 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  23.18 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  26.99 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  23.34 
 
 		 670 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  24.81 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  20 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  22.81 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.59 
 
 		 548 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  21.3 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  24.23 
 
 		 563 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  20.8 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  21.3 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  21.3 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  21.3 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  24.11 
 
 		 567 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  36.07 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  21.69 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  25.71 
 
 		 605 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  22.94 
 
 		 541 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  22.94 
 
 		 541 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  22.87 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  22.94 
 
 		 541 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  22.52 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  25.27 
 
 		 565 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  24.67 
 
 		 694 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  22.94 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  22.91 
 
 		 542 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  27.38 
 
 		 578 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3557  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  26.62 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  21.69 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  21.3 
 
 		 541 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  20.71 
 
 		 541 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  20.74 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  24.34 
 
 		 529 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>