26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3557 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3557  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  100 
 
 		 454 aa  920    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  23.5 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2870  hypothetical protein  21.62 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  25.66 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  21.84 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  24.83 
 
 		 538 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  23.35 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  24.1 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  23.48 
 
 		 569 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  22.05 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.9 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  21.74 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  25.82 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  22.72 
 
 		 540 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  21.63 
 
 		 550 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  27.64 
 
 		 527 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.75 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  23.65 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  23.65 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  23.65 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0578  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  26.37 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  19.82 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  21.46 
 
 		 576 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  23.34 
 
 		 563 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>