41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0592 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  888    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  56.93 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0572  hypothetical protein  42.69 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  43.68 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  41.88 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.16 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  23.53 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  25.89 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  23.96 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0578  hypothetical protein  22.46 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3557  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  28.37 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  26.42 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  24.91 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  27.12 
 
 		 737 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  27.12 
 
 		 737 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  26.44 
 
 		 737 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  19.14 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  28.57 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  25 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  25 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  25.07 
 
 		 738 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  25 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  25 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  25.84 
 
 		 558 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  24.34 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  25 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  24.78 
 
 		 740 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  26.1 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  24.41 
 
 		 738 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  23.83 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  29.57 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  25.19 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  20.31 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  25.42 
 
 		 737 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  25.42 
 
 		 740 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  31.55 
 
 		 532 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  20.55 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  24.41 
 
 		 738 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  22.06 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  24.07 
 
 		 542 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>