138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3358 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  100 
 
 		 434 aa  888    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  29.53 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  28.45 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  26.6 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  29.53 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  27.96 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  28.99 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  27.02 
 
 		 455 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  29.47 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  27.91 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  30.41 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  28.95 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  30.41 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  25.44 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  27.74 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  30.95 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  27.91 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  29.52 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  24.51 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  28.02 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.44 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  28.41 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  27.94 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.79 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  23.16 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.97 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.23 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  26.13 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  23.67 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  27.09 
 
 		 457 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  25.29 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.34 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  22.15 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  23.27 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24.4 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  23.77 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  22.95 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  23.77 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.82 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  22.75 
 
 		 538 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  23.57 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  23.77 
 
 		 541 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.54 
 
 		 554 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.6 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  23.36 
 
 		 541 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  23.57 
 
 		 541 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.15 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  24.82 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  26.65 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  26.2 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  28.57 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.17 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  25.57 
 
 		 678 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  23.58 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  21.9 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  24.61 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  25.32 
 
 		 701 aa  76.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  23.14 
 
 		 545 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  22.46 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  27.53 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  22.14 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  23.41 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  22.82 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  23.12 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  22.77 
 
 		 738 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.44 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  22.77 
 
 		 740 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  26.26 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  25 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  22.64 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  22.64 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  22.96 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  22.64 
 
 		 737 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  23.96 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  21.63 
 
 		 670 aa  70.5  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  22.5 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  22.88 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  23.34 
 
 		 738 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  22.5 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.81 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  24.75 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  22.26 
 
 		 719 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  22.44 
 
 		 750 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  22.46 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  22.62 
 
 		 741 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  21.86 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  24.05 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  21.86 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  21.86 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  21.86 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  21.86 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  21.86 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  22.26 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  24.53 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  20.66 
 
 		 733 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  21.9 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  23.49 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  23 
 
 		 717 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.66 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>