120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0928 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  100 
 
 		 550 aa  1109    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  55.77 
 
 		 518 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  53.05 
 
 		 548 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  49.15 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  53.3 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  51.45 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  53.58 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  53.58 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  53.58 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  51.91 
 
 		 562 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  52.26 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  49.14 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  49.03 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  45.96 
 
 		 558 aa  346  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  39.89 
 
 		 522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  40.76 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  40.65 
 
 		 545 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.57 
 
 		 596 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  38.98 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  40.15 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  39.81 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  39.47 
 
 		 527 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  38.94 
 
 		 532 aa  300  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  40.47 
 
 		 544 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  40.34 
 
 		 603 aa  290  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  39.62 
 
 		 563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  38.88 
 
 		 560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  39.19 
 
 		 704 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  36.23 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.66 
 
 		 578 aa  276  9e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  37.57 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  39.02 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  38.53 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  36.38 
 
 		 569 aa  269  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  36.04 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  39 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  38.43 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  36.13 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  36.13 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  36.13 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.25 
 
 		 565 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  35.54 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  36.26 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  21.21 
 
 		 457 aa  87.8  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  22.09 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.65 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  25.6 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  20.99 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  23.26 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.59 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  24.91 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  24.49 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.6 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  24.03 
 
 		 679 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  24.15 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  24.12 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.36 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  24.8 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  23.73 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  23.73 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  24.5 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  21.24 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  23.94 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  23.58 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  22.81 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.33 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.58 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  21.05 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  21.78 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  24.58 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  24.93 
 
 		 734 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  23.12 
 
 		 738 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  23.35 
 
 		 452 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  24.5 
 
 		 734 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  23.18 
 
 		 740 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  22.16 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  24.61 
 
 		 660 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  23.64 
 
 		 732 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.21 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  22.29 
 
 		 694 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  24.7 
 
 		 722 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  22.85 
 
 		 738 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  23.3 
 
 		 737 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  26.01 
 
 		 454 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  23.15 
 
 		 719 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  26.52 
 
 		 554 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  22.85 
 
 		 737 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.87 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  22.85 
 
 		 737 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  22.85 
 
 		 737 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  24.54 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.64 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  26.44 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24.73 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  23.6 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  21.95 
 
 		 553 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  24.32 
 
 		 701 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  23.44 
 
 		 718 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  23.44 
 
 		 725 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  23.44 
 
 		 718 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>