129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16391 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  72.83 
 
 
428 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  100 
 
 
428 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  71.43 
 
 
428 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  70.26 
 
 
428 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  39.29 
 
 
426 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  40.53 
 
 
426 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  41.77 
 
 
429 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  38.39 
 
 
432 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  38.29 
 
 
432 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  40.19 
 
 
426 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  33.18 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  31.58 
 
 
461 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  31.58 
 
 
461 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  31.34 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  31.22 
 
 
458 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  30.9 
 
 
472 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  30 
 
 
461 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  30.24 
 
 
457 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  28.04 
 
 
448 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  23.8 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  24.01 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  23.64 
 
 
452 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.56 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  21.98 
 
 
457 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  25.06 
 
 
446 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.58 
 
 
454 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  24.54 
 
 
454 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  22 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.04 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  23.44 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  23.75 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  23.7 
 
 
538 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  23.77 
 
 
694 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  21.83 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.72 
 
 
700 aa  80.5  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  26.25 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  24.51 
 
 
738 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  26.25 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  26.25 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.86 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  22.36 
 
 
718 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  22.36 
 
 
718 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  22.36 
 
 
718 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  22.36 
 
 
725 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  22.36 
 
 
718 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.09 
 
 
455 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  23.12 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  24.02 
 
 
679 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  22.36 
 
 
725 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  23.91 
 
 
572 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  23.28 
 
 
542 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  23.33 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  21.77 
 
 
719 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  24.38 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  24.38 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  24.02 
 
 
727 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  23.05 
 
 
740 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  23.65 
 
 
738 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  28.33 
 
 
733 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  22.69 
 
 
737 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  22.69 
 
 
737 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  24.83 
 
 
553 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  22.69 
 
 
737 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  23.22 
 
 
678 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  23.52 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  23.09 
 
 
541 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  23.09 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  22.34 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  28.89 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  22.34 
 
 
541 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  23.86 
 
 
738 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  22.58 
 
 
732 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  23.08 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  23.82 
 
 
724 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  23.32 
 
 
670 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  22.96 
 
 
701 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  21.66 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  20.77 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  20.44 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  24.06 
 
 
739 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  26.05 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  24.35 
 
 
742 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  23.32 
 
 
679 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  21.47 
 
 
740 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  28.37 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.93 
 
 
737 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.9 
 
 
565 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  23.59 
 
 
734 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  23.59 
 
 
741 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  27.75 
 
 
734 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.67 
 
 
596 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.94 
 
 
484 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  20.13 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  22.6 
 
 
550 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  24.14 
 
 
550 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  24.14 
 
 
550 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  24.14 
 
 
550 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  25.67 
 
 
576 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  22.18 
 
 
539 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  23.9 
 
 
527 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>