105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1895 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  100 
 
 		 446 aa  913    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  27.96 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  28.26 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  24.45 
 
 		 457 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  25.17 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  26.4 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.06 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.81 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.37 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  23.21 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.67 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  23.68 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.47 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.94 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  26.48 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.29 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  25.84 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  26 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  23.59 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.52 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  24.77 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  22.74 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  23.38 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  27.05 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.71 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  24.63 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  26.05 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  22.71 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  27.03 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  23.5 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.32 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.15 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.63 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  22.16 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  23.71 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  26.49 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  28.32 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.06 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  26.43 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  26.67 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  22.48 
 
 		 558 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.74 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  22.46 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  22.31 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  22.04 
 
 		 603 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  23.46 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  22.58 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  26.48 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  23.41 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  22.62 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  23.3 
 
 		 567 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  21.97 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.87 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  25.17 
 
 		 538 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  22.04 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  23.47 
 
 		 542 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  21.41 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  21.8 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  22.02 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  21.73 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  22.56 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  22.09 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  21.73 
 
 		 541 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  21.73 
 
 		 541 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  21.73 
 
 		 541 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  23.03 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  23.03 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  23.03 
 
 		 550 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  22.08 
 
 		 569 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  21.13 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  23.43 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  22.02 
 
 		 718 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  22.02 
 
 		 718 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  22.02 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  22.02 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  22.02 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  22.02 
 
 		 725 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  25.68 
 
 		 532 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0522  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  21.5 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  27.59 
 
 		 572 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  25.15 
 
 		 722 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.06 
 
 		 548 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  23.68 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  29.37 
 
 		 544 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  20.49 
 
 		 738 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  22.32 
 
 		 532 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  40 
 
 		 700 aa  47  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  22.02 
 
 		 719 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  21.4 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  24.41 
 
 		 576 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  21.4 
 
 		 738 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  21.47 
 
 		 737 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1520  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.12 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  21.47 
 
 		 737 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  41.67 
 
 		 782 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.99 
 
 		 578 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  23.15 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0704  hypothetical protein  26.94 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.455408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>