90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1520 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1520  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  100 
 
 		 342 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  30.84 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  27.43 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  28.76 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.81 
 
 		 426 aa  97.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  25.06 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  25.97 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  25.06 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  24.19 
 
 		 461 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  23.06 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.07 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  26.91 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  30.16 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  24.8 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.7 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.33 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  28.82 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.73 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  22.96 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.16 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.68 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.8 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.43 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  36.67 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  39.24 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  39.24 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.31 
 
 		 458 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  37.35 
 
 		 740 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  37.35 
 
 		 738 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  34.94 
 
 		 741 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  29.8 
 
 		 749 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  34.94 
 
 		 734 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  34.94 
 
 		 734 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  29.8 
 
 		 760 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  33.33 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  36.59 
 
 		 724 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  29.8 
 
 		 748 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  36.71 
 
 		 737 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  26.14 
 
 		 782 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  24.06 
 
 		 461 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  36.71 
 
 		 737 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  36.71 
 
 		 737 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  35 
 
 		 719 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  35 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  35 
 
 		 725 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  35 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  35 
 
 		 725 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  35 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  34.15 
 
 		 733 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  35 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  31.19 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  24.18 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  31.37 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  23.31 
 
 		 454 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  33.72 
 
 		 678 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  32.93 
 
 		 737 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  39.66 
 
 		 701 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  34.15 
 
 		 750 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  32.93 
 
 		 740 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  31.71 
 
 		 742 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  20.39 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  35.62 
 
 		 727 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  31.71 
 
 		 739 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  31.65 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  32.47 
 
 		 883 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  32.86 
 
 		 700 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  32.91 
 
 		 732 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  31.25 
 
 		 717 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  31.25 
 
 		 717 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  31.76 
 
 		 541 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.27 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.57 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  30.59 
 
 		 538 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4383  hypothetical protein  23.19 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00423799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  22.67 
 
 		 598 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  30.7 
 
 		 563 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  32.89 
 
 		 679 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  20.08 
 
 		 434 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  31.43 
 
 		 679 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  29.27 
 
 		 694 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>