128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  100 
 
 
578 aa  1154    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  46.9 
 
 
596 aa  442  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  45.08 
 
 
576 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  47.18 
 
 
550 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  47.18 
 
 
550 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  47.18 
 
 
550 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  46.38 
 
 
588 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  47.72 
 
 
605 aa  412  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  46.51 
 
 
569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  47.36 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  49.41 
 
 
565 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  45.89 
 
 
558 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  43.19 
 
 
572 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  45.9 
 
 
598 aa  362  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  40.87 
 
 
565 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  43.39 
 
 
532 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  43.69 
 
 
527 aa  342  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  39.43 
 
 
567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  42.77 
 
 
532 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  37.24 
 
 
540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  41.19 
 
 
518 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  40.44 
 
 
560 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  37.6 
 
 
550 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  44.22 
 
 
544 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  41.99 
 
 
538 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  39.81 
 
 
522 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  43.48 
 
 
603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.48 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  39.64 
 
 
563 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  38.14 
 
 
529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  40.95 
 
 
704 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  38.45 
 
 
545 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  36.75 
 
 
539 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  37.25 
 
 
549 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  40.47 
 
 
558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  37.89 
 
 
532 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  37.76 
 
 
534 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  38.96 
 
 
573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  38.14 
 
 
536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  38.14 
 
 
536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  38.14 
 
 
536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  36.4 
 
 
562 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  37.31 
 
 
567 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  21.76 
 
 
457 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  24.61 
 
 
434 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  26.09 
 
 
423 aa  88.2  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  26.67 
 
 
694 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  27.53 
 
 
660 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  26.15 
 
 
679 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  24.1 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  22.87 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.24 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  24.34 
 
 
741 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  27.12 
 
 
733 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  24.84 
 
 
737 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  25.49 
 
 
738 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  24.52 
 
 
678 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.71 
 
 
670 aa  73.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  25.49 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  23.3 
 
 
737 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  26.05 
 
 
738 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  25.73 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  26.14 
 
 
750 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  24.01 
 
 
738 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  24.08 
 
 
737 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  24.08 
 
 
737 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  24.26 
 
 
719 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  24.59 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  24.59 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  24.59 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  24.59 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  24.59 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  24.59 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  21.06 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  28.09 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  27.53 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  27.53 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  27.53 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  27.53 
 
 
541 aa  67  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  26.97 
 
 
541 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  22.65 
 
 
664 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  24.03 
 
 
701 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  26.4 
 
 
541 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24.14 
 
 
457 aa  65.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  26.97 
 
 
541 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  27.53 
 
 
541 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.49 
 
 
484 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  26.97 
 
 
538 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  22.18 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  26.67 
 
 
553 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  22.55 
 
 
395 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.49 
 
 
428 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  20.65 
 
 
457 aa  61.6  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  23.29 
 
 
461 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  23.29 
 
 
461 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  22.24 
 
 
452 aa  60.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  26.06 
 
 
734 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  27.93 
 
 
554 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  23.15 
 
 
535 aa  58.9  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  24.46 
 
 
458 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>