136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  100 
 
 		 596 aa  1185    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  61.44 
 
 		 605 aa  601  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  59.14 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  58.14 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  54.86 
 
 		 558 aa  527  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  45.26 
 
 		 569 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  46.86 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  46.86 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  46.86 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  46.93 
 
 		 576 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  44.44 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  45.8 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  48.58 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  45.71 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  42.83 
 
 		 532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  44.44 
 
 		 544 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  42.94 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.15 
 
 		 565 aa  349  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  41.86 
 
 		 518 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  40.14 
 
 		 560 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  44.54 
 
 		 538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  43.88 
 
 		 603 aa  327  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  37.71 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  43.68 
 
 		 527 aa  326  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  40.47 
 
 		 532 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  39.13 
 
 		 573 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  37.45 
 
 		 550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  39.07 
 
 		 548 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  40.99 
 
 		 539 aa  303  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  39.09 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  40.12 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  38.89 
 
 		 704 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  37.57 
 
 		 522 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  38.29 
 
 		 567 aa  280  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  36.19 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  35.88 
 
 		 529 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  37.2 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  37.2 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  37.2 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  37.31 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  36.79 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  37.36 
 
 		 532 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  37.92 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.72 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  25.08 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  24.61 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  25.08 
 
 		 738 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  24.79 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  22.09 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  24.92 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  24.92 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  24.92 
 
 		 737 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  24.26 
 
 		 718 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  24.26 
 
 		 718 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  24.26 
 
 		 725 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  24.26 
 
 		 725 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  24.26 
 
 		 718 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  24.26 
 
 		 718 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  25.31 
 
 		 694 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  25.47 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  26.45 
 
 		 750 aa  70.5  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  23.84 
 
 		 719 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  24.68 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  26.21 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  24.13 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  26.8 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.67 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  22.78 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  24.68 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  23.45 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.75 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  27.13 
 
 		 660 aa  64.3  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  22 
 
 		 541 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  28.18 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  24.82 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  22.36 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  22 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  22 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  22.44 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  21.9 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  22.08 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  22 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  21.9 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  22.18 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  22.58 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  23.42 
 
 		 740 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  22.58 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  22.26 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  20.76 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.13 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.69 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.79 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  21.72 
 
 		 538 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  23.79 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  29.63 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.72 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  23.57 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  23.87 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  24.61 
 
 		 727 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>