51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3459 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  243  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  43.33 
 
 		 267 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  32.79 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  31.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  32.23 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  30.84 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4778  putative signal peptide protein  35.09 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.221864  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  32.17 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1214  putative signal peptide protein  29.73 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.368519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0681  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I/II  28.68 
 
 		 708 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0850  hypothetical protein  30.97 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0258066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02054  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30.47 
 
 		 477 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.02911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1985  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  32.03 
 
 		 475 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0629  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30.23 
 
 		 485 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1823  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30 
 
 		 480 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1218  cytochrome c oxidase subunit I  25.98 
 
 		 477 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1959  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30.77 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0873293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  26.92 
 
 		 474 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2353  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.98 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3573  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  28.46 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3413  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.92 
 
 		 480 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0737361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1119  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  30.4 
 
 		 500 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.549677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0378  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  24.81 
 
 		 489 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.056136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30.47 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2211  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30.47 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000523358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000199184  normal  0.656675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2364  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3820  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  27.69 
 
 		 480 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2220  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00351736  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00937158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1613  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.92 
 
 		 480 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00989974  hitchhiker  0.00775448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2073  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.15 
 
 		 479 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2006  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00103508  hitchhiker  0.0000000337866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2201  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00427716  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4487  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1969  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00116918  normal  0.0108998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4255  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.92 
 
 		 480 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2107  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 478 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000291531  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1791  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.69 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398025  normal  0.231358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2425  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.69 
 
 		 474 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408104  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1851  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  30 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000190326  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0338  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.19 
 
 		 484 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0297011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1880  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  27.2 
 
 		 486 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2422  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25.38 
 
 		 490 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.505766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3332  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25.58 
 
 		 496 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2484  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I/II  29.57 
 
 		 717 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3857  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.36 
 
 		 532 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>