13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2991 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 125 aa  247  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  56 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  50.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0938  TonB-dependent receptor  51.18 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.278087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1766  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.783471  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  33.62 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  29.17 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  35.51 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1747  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  34.55 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  34.55 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  30.17 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>