13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1353 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  56 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0938  TonB-dependent receptor  48.82 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.278087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1766  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.783471  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1214  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.368519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  27.83 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  32.2 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  26.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  28.18 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  28.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  31 
 
 		 122 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>