13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1842 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  100 
 
 		 150 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  62.99 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  31.01 
 
 		 267 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4778  putative signal peptide protein  37.82 
 
 		 137 aa  83.6  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.221864  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1214  putative signal peptide protein  31.25 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.368519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  32.82 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  31.97 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1766  hypothetical protein  28.91 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.783471  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>