15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1578 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  100 
 
 		 134 aa  263  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  62.99 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  37.93 
 
 		 267 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1214  putative signal peptide protein  35.77 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.368519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4778  putative signal peptide protein  33.06 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.221864  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  30.58 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  28.93 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1766  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.783471  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4753  hypothetical protein  38.1 
 
 		 413 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0938  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.278087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>