12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4753 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4753  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  46.45 
 
 		 911 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  43.04 
 
 		 952 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  40.84 
 
 		 857 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  44.6 
 
 		 912 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  39.18 
 
 		 856 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  36.68 
 
 		 969 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1640  hypothetical protein  37.28 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  36.89 
 
 		 878 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  35.39 
 
 		 876 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0513  hypothetical protein  38.51 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.205533  normal  0.681284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 134 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>