15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0850 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0258066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  30.97 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0081  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  28.49 
 
 		 497 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0206763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1919  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  26.74 
 
 		 488 aa  45.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0629  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  27.22 
 
 		 485 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0378  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25.58 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.056136  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4962  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  29.17 
 
 		 540 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1663  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 488 aa  41.6  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1482  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 488 aa  41.6  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1836  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 488 aa  41.6  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.67019  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1399  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25.15 
 
 		 488 aa  41.2  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0902  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  25.88 
 
 		 494 aa  41.2  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  27.93 
 
 		 541 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  28.49 
 
 		 474 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2871  cytochrome-c oxidase  33.04 
 
 		 572 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0957235  normal  0.927899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>