More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1823 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0939  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  72.47 
 
 		 482 aa  725    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0453  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.19 
 
 		 480 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.922197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4250  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.98 
 
 		 474 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4255  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  95.62 
 
 		 480 aa  938    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1276  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  75.6 
 
 		 485 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.19 
 
 		 491 aa  725    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.41805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  73.65 
 
 		 474 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3820  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  95.42 
 
 		 480 aa  936    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1084  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71 
 
 		 479 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2364  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.61 
 
 		 478 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1744  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.22 
 
 		 496 aa  692    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2004  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  88.94 
 
 		 480 aa  855    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2604  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  87.29 
 
 		 480 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000152837  normal  0.741537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1277  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.15 
 
 		 476 aa  718    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3413  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  87.29 
 
 		 480 aa  872    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0737361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0778  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  66.6 
 
 		 493 aa  684    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0713  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.88 
 
 		 475 aa  703    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000329894  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2353  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  66.09 
 
 		 472 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000365597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2425  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  75 
 
 		 474 aa  745    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408104  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.33 
 
 		 482 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0338  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  64.03 
 
 		 484 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0297011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2107  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.61 
 
 		 478 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000291531  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0643  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  74.34 
 
 		 473 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000439174  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1618  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.98 
 
 		 474 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  0.0588114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1985  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.72 
 
 		 475 aa  753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3573  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  95.42 
 
 		 480 aa  935    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2478  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.82 
 
 		 480 aa  690    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1959  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.18 
 
 		 478 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0873293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1823  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 480 aa  970    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1827  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.79 
 
 		 474 aa  836    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2512  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  81.26 
 
 		 475 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2775  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.22 
 
 		 478 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.605339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0958  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.95 
 
 		 475 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0979649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  71 
 
 		 479 aa  701    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3782  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.3 
 
 		 478 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0141509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02054  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.23 
 
 		 477 aa  750    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.02911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02303  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.89 
 
 		 477 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0631  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  77.02 
 
 		 472 aa  727    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479145  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4487  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.39 
 
 		 478 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  68.33 
 
 		 479 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1930  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  67.95 
 
 		 478 aa  679    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000131874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.39 
 
 		 478 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2422  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.45 
 
 		 490 aa  739    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.505766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1523  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  69.98 
 
 		 479 aa  716    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  75.32 
 
 		 478 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000208976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3816  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.19 
 
 		 474 aa  811    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1197  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.82 
 
 		 485 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1104  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  72.82 
 
 		 485 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460465  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4305  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.55 
 
 		 477 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0405155  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2201  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.39 
 
 		 478 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00427716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1851  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  75.75 
 
 		 477 aa  747    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000190326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3777  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  89.26 
 
 		 475 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.19 
 
 		 486 aa  688    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1613  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  95.62 
 
 		 480 aa  938    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00989974  hitchhiker  0.00775448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  66.6 
 
 		 493 aa  685    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2044  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.12 
 
 		 482 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0265889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2211  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  75.86 
 
 		 475 aa  751    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2220  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.39 
 
 		 478 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00351736  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44370  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  89.47 
 
 		 475 aa  883    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003467  cytochrome c oxidase subunit CcoN  75.11 
 
 		 475 aa  744    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2073  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  74.37 
 
 		 479 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0157886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2818  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  70.15 
 
 		 479 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1563  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  74.24 
 
 		 476 aa  731    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1784  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  78.36 
 
 		 476 aa  777    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.39 
 
 		 478 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000199184  normal  0.656675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3569  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.62 
 
 		 474 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3773  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.53 
 
 		 475 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2006  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.61 
 
 		 478 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00103508  hitchhiker  0.0000000337866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1969  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.61 
 
 		 478 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00116918  normal  0.0108998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2599  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  80.97 
 
 		 479 aa  812    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00049011  normal  0.717457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3436  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.05 
 
 		 480 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1882  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  73.02 
 
 		 474 aa  722    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.746133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1791  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.18 
 
 		 478 aa  755    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398025  normal  0.231358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.72 
 
 		 475 aa  756    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000523358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  86.19 
 
 		 480 aa  862    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1053  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  76.04 
 
 		 477 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0569715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10500  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  83.16 
 
 		 475 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40510  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.87 
 
 		 480 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44340  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  82.53 
 
 		 475 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0629  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.75 
 
 		 485 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3000  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.89 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1676  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.63 
 
 		 552 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1880  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  62.89 
 
 		 486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1532  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  63.97 
 
 		 563 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94152 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2092  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.03 
 
 		 549 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0469  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.02 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222667  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4962  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.66 
 
 		 540 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0459  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63.44 
 
 		 555 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306699  normal  0.0526078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2792  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  63 
 
 		 539 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3332  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.49 
 
 		 496 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0158  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  60.61 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.363228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0363  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.96 
 
 		 541 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2578  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.69 
 
 		 548 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0015  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  61.46 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0379  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  59.75 
 
 		 541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3270  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.79 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216539  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0020  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.55 
 
 		 548 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0730  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.55 
 
 		 548 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5935  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.21 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6268  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  62.21 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  0.108359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>