59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0801 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1076    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  44.83 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  41.19 
 
 		 455 aa  353  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  39.82 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  37.64 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  53.68 
 
 		 231 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  38.48 
 
 		 427 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  35.78 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  36.85 
 
 		 509 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  36.57 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  35.71 
 
 		 463 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.19 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 463 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  36.01 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  35.78 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  33.75 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  37.12 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  35.17 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  35.17 
 
 		 491 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  35.92 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  36.24 
 
 		 510 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  36.24 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  36.24 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  35.68 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  35.1 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  34.02 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  36.01 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  34.02 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  34.02 
 
 		 488 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  34.94 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  34.64 
 
 		 473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  31.98 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  35.44 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  33.62 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  31.29 
 
 		 564 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  27.59 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.01 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  25.93 
 
 		 580 aa  94.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  28.61 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  24.44 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  27.09 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  33.61 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  29.28 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  27.64 
 
 		 464 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  26.05 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  26.18 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  25.45 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  25.19 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2438  hypothetical protein  24.75 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  23.57 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  24.71 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  34.02 
 
 		 130 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  25.14 
 
 		 518 aa  53.9  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2808  hypothetical protein  26.4 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711174  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2831  hypothetical protein  23.47 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625955  hitchhiker  0.000000000887118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  23.93 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  28.96 
 
 		 597 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>