36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0622 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1048    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  47.56 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  30.1 
 
 
513 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  28.91 
 
 
514 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.84 
 
 
464 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  26.84 
 
 
514 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  26.72 
 
 
508 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  26.47 
 
 
473 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  26.47 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  23.61 
 
 
564 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  27.16 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  25.44 
 
 
441 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  24.44 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  26.76 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  25.19 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  24.31 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  23.1 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  25.12 
 
 
481 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  22.36 
 
 
449 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  23.14 
 
 
477 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  24.55 
 
 
231 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  21.33 
 
 
463 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  21.94 
 
 
463 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  23.3 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  21.19 
 
 
463 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  20.95 
 
 
492 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  30.46 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  23.19 
 
 
487 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  21.76 
 
 
514 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  25 
 
 
529 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  23 
 
 
553 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  23.32 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  21.3 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  21.26 
 
 
510 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  20.88 
 
 
514 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  31.86 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.41171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>