12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0587 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1059    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  35.56 
 
 		 555 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3039  hypothetical protein  32.48 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0289115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  25.14 
 
 		 530 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  30.65 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.95 
 
 		 564 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  24.84 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  32.29 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  30.69 
 
 		 473 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  31.87 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  33.75 
 
 		 514 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>