55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2395 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  962    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  66.36 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  63.62 
 
 		 488 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  57.36 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  59.28 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  58.16 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  59.05 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  55.07 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  58.16 
 
 		 510 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  58.26 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  59.28 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  57.74 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  57.7 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  57.7 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  57.34 
 
 		 491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  56.88 
 
 		 491 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  55.46 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  55.5 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  55.73 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  55.73 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  56.06 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.99 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  34.99 
 
 		 463 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  34.62 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  32.76 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  36.01 
 
 		 530 aa  223  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  30.5 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  30 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  28.05 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  28.85 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  27.48 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  30.15 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  25.62 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  27.9 
 
 		 481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  30.45 
 
 		 231 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.3 
 
 		 564 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  26.16 
 
 		 572 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  25.26 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.34 
 
 		 464 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  24.75 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  25.41 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  25.41 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  23.14 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  29.91 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  28.77 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  39.08 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  29.67 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  29.67 
 
 		 508 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  29.67 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  30.65 
 
 		 518 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  27.43 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  29.63 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  24.77 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  23.7 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  25.38 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>