49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2383 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  69.2 
 
 		 510 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  65.24 
 
 		 488 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  68.51 
 
 		 512 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  63.98 
 
 		 514 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  65.24 
 
 		 488 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  68.51 
 
 		 512 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  68.35 
 
 		 487 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1021    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  73.7 
 
 		 553 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  64.63 
 
 		 488 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  64 
 
 		 514 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  63.03 
 
 		 492 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  73.92 
 
 		 529 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  72.48 
 
 		 480 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  89.79 
 
 		 509 aa  854    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  73.7 
 
 		 561 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  66.59 
 
 		 491 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  65.5 
 
 		 491 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  59.68 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  57.74 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  56.92 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  34.58 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  34.58 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  36.57 
 
 		 530 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  33.41 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  33.71 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  33.88 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  32.88 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  33.71 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  32.01 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  28.29 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  30.2 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  29.77 
 
 		 481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  26.09 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  27.84 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.14 
 
 		 572 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  26.75 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  28.35 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  22.94 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  27.34 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  25.34 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  45.83 
 
 		 130 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  26.33 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  26.59 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  26.59 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  26.12 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.515589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>